PE6d蛋白

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产品简介：

PE6蛋白是一类通过噬菌体辅助连续进化（PACE）和理性设计优化的新型Prime Editor，其核心由Cas9切口酶与逆转录酶（RT）融合而成，分为多个亚型（PE6a-g），针对不同编辑需求优化。

PE6a

PE6a基于进化后的Ec48逆转录酶（RT），基因大小仅1.2 kb，比PEmax缩短810 bp。其通过噬菌体辅助连续进化（PACE）优化，结合理性设计突变（如T189N），在哺乳动物细胞中平均编辑效率达PEmax的80%。适用于需要极小编辑器尺寸的场景，如AAV递送，尤其在短模板编辑中表现优异，但对长复杂编辑效率较低。

PE6b

PE6b采用进化优化的Tf1 RT（1.5 kb），通过结构指导突变（如K118R）和实验室进化增强。其编辑效率与PEmax相当，尤其擅长短模板编辑，且因较低的RT加工性减少支架序列插入导致的副产物，适合低复杂度编辑。但对长或高度结构化模板的处理能力有限。

PE6c

PE6c结合进化与理性设计的Tf1 RT（含16个突变），基因尺寸与PEmaxΔRNaseH相当（约1.5 kb）。其RT加工性显著提升，可高效处理长且高度结构化的模板（如loxP插入），在双AAV递送中效率比PEmaxΔRNaseH高2.3倍，尤其适用于复杂插入和双链编辑（twinPE）。

PE6d

PE6d为截断型M-MLV RT（去除RNaseH结构域），通过进化获得关键突变（如T128N）。基因大小1.5 kb，加工性超越PEmax，在长模板（如40 bp插入）编辑中效率提升1.9倍，尤其适合结构化RTT。体内递送时，小鼠大脑loxP插入效率达62%（比前代高24倍），是双AAV系统的首选。

PE6e

PE6e在Cas9结构域引入K775R和K918A突变，位于L1/L2连接区，增强R环稳定性。其编辑效率在部分位点（如CXCR4）较PEmaxΔRNaseH提升1.8倍，但对不同靶点效果差异大，建议与高效RT（如PE6a/c）联用以补偿Cas9活性损失。

PE6f

PE6f携带H721Y突变（影响sgRNA结合）和D645N（DNA结合界面），可提升特定靶点（如HEK3位点）的编辑效率。其效果依赖R环构象，与低加工性RT（如PE6b）联用可优化编辑-副产物比，适用于需要精准调控Cas9-DNA互作的场景。

PE6g

PE6g整合R654C和I632V等Cas9突变，平衡DNA结合强度与编辑活性。在双链编辑中（如PAH基因），与PE6c联用使效率提升2.9倍，但可能降低部分位点的靶向亲和力。推荐用于需高精度的大片段插入或替换。

参考文献

Doman, J. L. et al. Phage-assisted evolution and protein engineering yield compact, efficient prime editors. Cell 186, 3983-4002.e26 (2023).