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Hi-SD polymerase

Hi-SD polymerase

具备Phi29/Bst的强链置换酶活和Taq的热稳定性,可耐受93℃高温。

*若您需要这支酶的表达载体和菌株,可以联系我们。

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具备Phi29/Bst的强链置换酶活和Taq的热稳定性,可耐受93℃高温。

*若您需要这支酶的表达载体和菌株,可以联系我们。


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包装内容:

产品编号

产品名称

包装

P2024

Hi-SD polymerase (50U/μl)

2000U

B2024

10X Hi-SD PCR Buffer

1ml

K1015

MgCl2 (100mM)

1ml

K1002

dNTP (10mM each)

150μl

B1001

6X DNA Loading Buffer

1ml

  

产品简介:

基于Taq聚合酶的基因工程酶,同时具备Phi29/Bst的强链置换酶活和Taq的热稳定性,可耐受93℃高温。

具有5'-3'聚合酶活性、5'-3'链置换活性,无外切酶活性,扩增速度2kb/min

适用于热变性PCDR (Polymerase Chain Displacement Reaction)LAMP反应、长片段扩增、富含GC片段扩增,还可用于全基因组测序(WGA)、单细胞测序和NGS建库。

70℃30分钟内将10 nmol脱氧核苷酸掺入到酸不溶性物质所需的酶量定义为1个活性单位(U)。

  

使用说明:

反应体系:解冻并彻底混匀各组分,于冰浴设置如下反应体系。

Component

50μl reaction

Final Concentration

10X Hi-SD PCR Buffer

5μl

1X

10mM dNTPs

1.75μl

350µM

100mM MgCl2

1.5μl

3mM

10µM Forward Primer

2μl

0.2µM (0.05~1µM)

10µM Reverse Primer

2μl

0.2µM (0.05~1µM)




Template   DNA

xμl

Genomic DNA  

0.1–1μg

plasmid or viral DNA

0.1–10ng

cDNA

1-5μl




Taq DNA Polymerase (5U/μl)

0.25-0.5µl

1.25-2.5units/50µl PCR

Nuclease-free water

Up to 50µl


  

设置如下热循环程序,开始PCR反应。

Step

Temp.

Time

Initial   Denaturation

92°C

1min

30 Cycles

Denaturation

92°C

30s

Annealing

45-68°C, Tm-5℃

30s

Extension

68°C

2min/kb

Final   Extension

68°C

5min

Hold

4°C


 

常见问题及建议

1.      严格设置阳性对照和阴性对照。

2.      引物设计

(1)    建议使用专业软件如OligoPrimer,引物长度15-30碱基,GC含量40-60%Tm值接近。

(2)    避免形成引物自身或引物间二聚体。

(3)    避免引物3’端连续3个及以上G或者C导致非特异性扩增。

3.      无产物

(1)    酶失活或未加入酶。

(2)    模板含有杂质,改善纯化方法。

(3)    蛋白酶/核酸酶污染,反应前体系95℃加热5-10分钟。

(4)    退火温度不佳,建议进行梯度退火PCR优化。

(5)    引物浓度太低,适当增加浓度范围0.05-1μM

(6)    引物设计不佳,需要考虑GC含量、二级结构、二聚体、退火温度、长度、特异性等因素重新设计合成引物。

(7)    反应条件欠佳,适当优化Mg2+浓度,增加循环数。

4.      产物少

(1)    退火温度不佳,建议进行温度梯度PCR优化。

(2)    DNA模板量太少,予以适当增加。

(3)    PCR循环数不足,增加循环次数。

(4)    引物量不足,增加体系引物浓度。

(5)    延伸时间太短,适当增加延伸时间。

(6)    变性时间过长会导致DNA聚合酶失活,适当调整。

(7)    DNA模板中存在抑制剂,确保DNA模板干净。

5.      非特异性扩增

(1)    引物浓度高,特异性差。重新设计合成或降低引物终浓度。

(2)    循环的次数过多。适当增加模板量,减少循环次数。

(3)    酶的用量偏高或酶的质量不好,降低酶量或使用高质量的聚合酶。

(4)    退火温度偏低,退火及延伸时间偏长。应提高退火温度,减少变性与延伸时间。

(5)    Mg2+浓度不佳,适当进行梯度浓度PCR优化。

(6)    复制提前终止,当使用非热启动的聚合酶时常见;应在冰上准备反应或采用热启动聚合酶。

(7)    模板量过多,适当调整。

(8)    外源DNA污染,建议重新纯化。