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2X GBD预混反应体系
*若您需要这支酶的表达载体和菌株,可以联系我们。
-20℃储存,<0℃运输。
包装内容:
产品编号 | 产品名称 | 包装 |
P20021 | 2X GBD PreMix | 5ml |
B1001 | 6X DNA Loading Buffer | 2ml |
产品简介:
GBD DNA Polymerase具有中等保真度和稳健扩增效能,适用于高GC含量/复杂二级结构模板PCR。
延伸速率1 kb/min,错配率~2×10-5,保真度为Taq的5倍
来源于耐热菌Pyrococcusspecies GB-D,高度热稳定,95°C半衰期大于23小时。
具有5′-3′DNA聚合酶,无5′-3′外切酶和3′-5′核酸外切酶活性。产物为平滑末端。
于75℃,30分钟内将10 nmol脱氧核苷酸掺入到酸不溶性物质所需的酶量定义为1个活性单位(U)。
无外源核酸酶活性,无宿主DNA/RNA;蛋白纯度大于99%。
使用说明:
反应体系:解冻并彻底混匀各组分,于冰浴设置如下反应体系。
Component | 50μl reaction | Final Concentration | |
2X GBD PreMix | 25μl | 1X | |
10µM Forward Primer | 1μl | 0.2µM (0.1~0.5µM) | |
10µM Reverse Primer | 1μl | 0.2µM (0.1~0.5µM) | |
Template DNA | xμl | Genomic DNA | 0.1–1μg |
plasmid or viral DNA | 0.1–10ng | ||
cDNA | 1-5μl | ||
Nuclease-free water | Up to 50µl |
设置如下热循环程序,开始PCR反应。
Step | Temp. | Time | |
Initial Denaturation | 95°C | 5min | |
30 Cycles | Denaturation | 95°C | 15s |
Annealing | Tm-5°C | 30s | |
Extension | 72°C | 1min/kb | |
Final Extension | 72°C | 5min | |
Hold | 4-10°C |
常见问题及建议
1. 严格设置阳性对照和阴性对照。
2. 引物设计
(1) 建议使用专业软件如Oligo或Primer,引物长度20-35碱基,GC含量40-60%,Tm值接近。
(2) 避免形成引物自身或引物间二聚体。
(3) 避免引物3’端连续3个及以上G或者C导致非特异性扩增。
3. 产物少/无产物
(1) 酶失活或未加入酶。
(2) 纯化模板,调整模板量。
(3) 适当降低退火温度,建议进行梯度退火PCR优化。
(4) 优化引物浓度, 0.1-0.5μM。
(5) 引物设计不佳,需要考虑GC含量、二级结构、二聚体、退火温度、长度、特异性等因素重新设计合成引物。
(6) 优化循环条件,增加延伸时间和循环数。
4. 非特异性扩增
(1) 引物浓度高,特异性差。重新设计合成或降低引物终浓度。
(2) 循环的次数过多。适当增加模板量,减少循环次数。
(3) 酶的用量偏高或酶的质量不好,降低酶量或使用高质量的聚合酶。
(4) 退火温度偏低,退火及延伸时间偏长。应提高退火温度,减少变性与延伸时间。
(5) Mg2+浓度不佳,适当进行梯度浓度PCR优化。
(6) 复制提前终止,当使用非热启动的聚合酶时常见;应在冰上准备反应或采用热启动聚合酶。
(7) 模板量过多,适当调整。
(8) 外源DNA污染,建议重新纯化。